Дейтерозамещение и удерживание зарядов в ионах органических и биоорганических соединений. 1. Апамин

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

В настоящей работе продолжено развитие нового метода, позволяющего обнаружить различные структурные формы исследуемых биомолекул или органических соединений при разделении масс-спектров дейтероводородного (H/D) обмена многозарядных (z > 1) или однозарядных (z = 1) ионов. Суть метода разделения – наилучшая аппроксимация полученных при электрораспылении растворов электролитов масс-спектров линейной комбинацией некоторого числа H/D/z-распределений при независимой замене подвижных атомов H на D и независимом удерживании некоторого числа носителей заряда. Апробация метода выполнена на примере апамина, полипептида из 18 аминокислот с молекулярной массой около 2025.886 Да. Проанализировано соответствие полученных масс-спектральных компонент структурным формам апамина, образовавшимся в процессе дейтерообмена при напуске газа, содержащего ND3, и при отсутствии такого потока.

Об авторах

В. В. Разников

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семёнова Российской академии наук

Email: raznikova.mari@yandex.ru
Москва, Россия

М. О. Разникова

Федеральный исследовательский центр проблем химической физики и медицинской химии Российской академии наук

Email: raznikova.mari@yandex.ru
Черноголовка, Россия

А. Р. Пихтелев

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семёнова Российской академии наук

Email: raznikova.mari@yandex.ru
Москва, Россия

С. В. Филатов

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семёнова Российской академии наук

Email: raznikova.mari@yandex.ru
Москва, Россия

И. В. Сулименков

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семёнова Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: raznikova.mari@yandex.ru
Москва, Россия

Список литературы

  1. Kaltashov I.A., Abzalimov R.R. // J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008. V. 19. № 8. P. 1239. https://doi.org/10.1016/j.jasms.2008.05.018
  2. Frimpong A.K., Abzalimov R.R., Uversky V.N., Kaltashov I.A. // Proteins. 2010. V. 78. № 3. P. 714. https://doi.org/10.1002/prot.22604
  3. Разникова М.О., Разников В.В. // Хим. физика. 2001. Т. 20. № 4. С. 13.
  4. Raznikov V.V., Raznikova M.O., Sulimenkov I.V. // Anal. Bioanal. Chem. 2019. V. 411. № 24. P. 6409. https://doi.org/10.1007/s00216-019-02019-2
  5. Степанов В.М. Молекулярная биология. Структура и функции белков. М.: Наука, 2005.
  6. Masson G.R., Burke J.E., Ahn N.G. et al. // Nature Methods. 2019. V. 596. P. 595. https://doi.org/10.1038/s41592-019-0459-y
  7. Abzalimov R.R., Kaltashov I.A. // J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2006. V. 17. № 11. P. 1543. https://doi.org/10.1016/j.jasms.2006.07.017.
  8. Xiao H., Hoerner J.K., Eyles S.J. et al. // Protein Sci. 2005. V. 14. № 2. P. 543. https://doi.org/10.1110/ps.041001705
  9. Kostyukevich Y., Acter T., Zherebker A. et al. // Mass Spectrom. Rev. 2018. V. 37. № 6. P. 1. https://doi.org/10.1002/mas.21565
  10. Разникова М.О., Разников В.В. // Хим. физика. 2005. Т. 24. № 1. С. 13.
  11. Raznikov V.V., Raznikova M.O. // Eur. J. Mass Spectrom. 2009. V. 15. P. 367.
  12. Разникова М.О., Разников В.В. // Молекуляр. биология. 2015. Т. 49. № 5. С. 817. https://doi.org/10.7868/S0026898415050146
  13. Разникова М.О., Разников В.В. // Хим. физика. 2018. Т. 37. № 4. С. 59. https://doi.org/10.7868/S0207401X18040076
  14. Разников В.В., Разникова М.О., Придатченко М.Л. // Масс-спектрометрия. 2016. Т.13. № 2. С. 124.
  15. Разников В.В., Зеленов В.В., Апарина Е.В., Сулименков И.В., Разникова М.О. // Масс-спектрометрия. 2020. Т. 17. №. 2. С. 103. https://doi.org/10.25703/MS.2020.17.26
  16. Kostyukevich Y., Kononikhin A., Popov I., Nikolaev E. // Anal. Chem. 2013. V. 85. P. 5330. https://doi.org/10.1021/ac4006606
  17. Dodonov A.F., Kozlovski V.I., Soulimenkov I.V. et al. // Eur. J. Mass Spectrom. 2000. V. 6. № 6. P. 481. https://doi.org/10.1255/ejms.378
  18. Raznikov V.V., RaznikovaM.O., Sulimenkov I.V., Zelenov V.V. // Anal. Bioanal. Chem. 2023. V. 415. № 12. P. 2193. https://doi.org/10.1007/s00216-023-04625-7
  19. Dempsey C.E. // Biochemistry. 1986. V. 25. P. 3904. https://doi.org/10.1021/bi00361a025
  20. Suvorina M.Y., Surin A.K., Dovidchenko N.V., Lobanov M.Y., Galzitskaya O.V. // Biochemistry (Moscow). 2012. V. 77. P. 616. https://doi.org/10.1134/S0006297912060089
  21. Wang F, Tang X. // Biochemistry. 1996. V. 35. P. 4069. https://doi.org/10.1021/bi9521304
  22. Крамер Г. Математические методы статистики. М.: Мир, 1975.
  23. Raznikov V.V., Raznikova M.O. // Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes. 1985. V. 63. P. 157. https://doi.org/10.1016/0168-1176(85)80023-9
  24. Raznikov V.V., Raznikova M.O. // Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes. 1991. V. 103. P. 67. https://doi.org/10.1016/0168-1176(91)80079-3
  25. Дубовицкий В.А., Иржак В.И. // Высокомолекуляр. соединения. Б. 2005. Т.47. № 1. С. 121.
  26. Kuzmenkov A.I., Peigneur S., Nasburg J.A. et al. // Front. Pharmacol. 2022. V. 13. 977440. https://doi.org/10.3389/fphar.2022.977440
  27. Разников В.В., Разникова М.О., Сулименков И.В., Зеленов В.В. // Масс-спектрометрия. 2023. Т. 20. № 2. С. 77. https://doi.org/10.25703/MS.2023.20.08
  28. Chen S.H., Russell D.H. // J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2015. V. 26. № 9. P. 1433. https://doi.org/10.1007/s13361-015-1191-1
  29. Purves R.W., Barnett D.A., Guevremont R. // Int. J. Mass Spectrom. 2000. V. 197. P. 163. https://doi.org/10.1016/S1387-3806(99)00240-7
  30. Москаленко И.В., Тихонов И.В. // Хим. физика. 2022. Т. 41. № 7. С. 18. https://doi.org/10.31857/S0207401X22070123
  31. Шайтан К.В. // Хим. физика. 2023. T. 42. № 6. С. 40. https://doi.org/10.31857/S0207401X23060109
  32. Шишкина Л.Н., КозловМ.В., КонстантиноваТ.В., СмирноваА.Н., ШвыдкийВ.О. // Хим. физика. 2023. T. 42. № 1. С. 28. https://doi.org/10.31857/S0207401X23010107
  33. Смирнова А.Н., Швыдкий В.О., Шишкина Л.Н. // Хим. физика. 2021. T. 40. № 7. С. 43. https://doi.org/10.31857/S0207401X21070104
  34. Яковлева М.А., Радченко А.Ш., Костюков А.А. и др. // Хим. физика. 2022. Т. 41. № 2. С. 20. https://doi.org/10.31857/S0207401X22020169
  35. Васильева А.Д., Юрина Л.В., Азарова Д.Ю. и др. // Хим. физика. 2022. Т. 41. № 2. С. 51. https://doi.org/10.31857/S0207401X22020145
  36. Зеленов В.В., Апарина Е.В. // Хим. физика. 2024. Т. 43. № 6. С. 53. https://doi.org/10.31857/S0207401X24060069

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2025